Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRIP4Q15650 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms