Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIP13Q15645 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms