Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC23BQ15437 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEC23BQ15437 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms