Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.782e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.752e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.712e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 SRSF2-207ENST00000583836 561 ntTSL 519.36■□□□□ 0.692e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 ISOC2-207ENST00000590921 2283 ntTSL 219.35■□□□□ 0.692e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.682e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.642e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.632e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.622e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 TANGO2-226ENST00000490583 888 ntTSL 318.77■□□□□ 0.62e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 TANGO2-203ENST00000399807 2241 ntTSL 518.58■□□□□ 0.562e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 ARHGEF2-216ENST00000495070 571 ntTSL 418.39■□□□□ 0.532e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.522e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.492e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 ASF1B-204ENST00000590835 746 ntTSL 518.08■□□□□ 0.482e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.472e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 LINC01089-203ENST00000535614 480 ntTSL 417.95■□□□□ 0.462e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 SRSF2-204ENST00000452355 1357 ntTSL 517.71■□□□□ 0.432e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 MYL12A-208ENST00000580353 565 ntTSL 217.66■□□□□ 0.422e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.382e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 E4F1-209ENST00000569796 5931 ntTSL 217.08■□□□□ 0.322e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.322e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.272e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.272e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PHF19-213ENST00000487555 1092 ntTSL 1 (best)16.64■□□□□ 0.252e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.22e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.22e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.23e-8■■■■□ 20
PCBP1Q15365 SRSF2-208ENST00000585202 1359 ntTSL 316.01■□□□□ 0.152e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.132e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PER1-218ENST00000585095 691 ntTSL 315.74■□□□□ 0.112e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 TANGO2-213ENST00000444651 847 ntTSL 315.6■□□□□ 0.092e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 ARHGEF2-213ENST00000476273 668 ntTSL 315.45■□□□□ 0.062e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.052e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 COQ8A-205ENST00000478406 3612 ntTSL 215.15■□□□□ 0.022e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PER1-212ENST00000581395 3209 ntTSL 215.12■□□□□ 0.012e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PER1-204ENST00000577424 626 ntTSL 314.84□□□□□ -0.032e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.042e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.082e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 MBD6-205ENST00000547844 387 ntTSL 514.53□□□□□ -0.082e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.112e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.112e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 TANGO2-221ENST00000476940 414 ntTSL 514.31□□□□□ -0.122e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.153e-8■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.162e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.182e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 LINC01089-205ENST00000536662 560 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.182e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 ALDH1A2-204ENST00000537372 3700 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.222e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PML-209ENST00000562086 2232 ntTSL 1 (best)13.5□□□□□ -0.252e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 SOGA1-204ENST00000465671 4478 ntTSL 212.91□□□□□ -0.342e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.352e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.352e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 ARHGEF2-203ENST00000361247 4149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.362e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 ARHGEF2-211ENST00000471589 892 ntTSL 512.68□□□□□ -0.382e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.392e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.42e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 ARHGEF2-207ENST00000465079 693 ntTSL 212.52□□□□□ -0.412e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 MYL12A-207ENST00000579226 947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.422e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PML-207ENST00000435786 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.432e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 C22orf34-206ENST00000444628 453 ntTSL 512.15□□□□□ -0.462e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.491e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 MYL12A-206ENST00000578611 1004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.512e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 LARP4B-201ENST00000316157 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.512e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.511e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 MYL12A-211ENST00000585090 614 ntTSL 311.73□□□□□ -0.532e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 LINC01089-204ENST00000535643 1014 ntTSL 1 (best)11.71□□□□□ -0.532e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 MYL12A-210ENST00000583449 334 ntTSL 211.47□□□□□ -0.572e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 TNFAIP2-211ENST00000561217 603 ntTSL 311.46□□□□□ -0.572e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PLEC-201ENST00000322810 15249 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.631e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PCMTD2-203ENST00000308824 3843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.633e-8■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.661e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 MYL12A-201ENST00000217652 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.662e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.681e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PLEC-206ENST00000357649 14689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.681e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PLEC-203ENST00000354589 14736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.691e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 ALDH1A2-202ENST00000347587 3297 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.692e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 LARP4B-210ENST00000609318 4848 ntTSL 1 (best)10.65□□□□□ -0.72e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 ZNF496-203ENST00000462139 9243 ntTSL 1 (best)10.65□□□□□ -0.712e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 ZMAT2-201ENST00000274712 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.722e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 ANXA2-203ENST00000421017 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.732e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 ANXA2-223ENST00000559647 484 ntTSL 210.13□□□□□ -0.792e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 TBC1D13-201ENST00000223865 3378 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.822e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 ANXA2-204ENST00000451270 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.832e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PLEC-207ENST00000398774 14646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.881e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 ALDH1A2-203ENST00000430119 3049 ntTSL 29.53□□□□□ -0.882e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 ALDH1A2-221ENST00000560312 3146 ntTSL 1 (best)9.25□□□□□ -0.932e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 ANXA2-202ENST00000396024 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.932e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 ANXA2-228ENST00000560014 2339 ntTSL 29.08□□□□□ -0.962e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 ANXA2-205ENST00000504475 3528 ntTSL 28.83□□□□□ -12e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 ZNF496-202ENST00000461277 3857 ntTSL 1 (best)8.39□□□□□ -1.072e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PARP16-203ENST00000558873 838 ntTSL 58□□□□□ -1.132e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 PCMTD2-208ENST00000609764 572 ntTSL 47.47□□□□□ -1.213e-8■■■■□ 20
PCBP1Q15365 ARHGEF2-214ENST00000477754 883 ntTSL 56.51□□□□□ -1.372e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 ALDH1A2-209ENST00000558384 466 ntTSL 34.88□□□□□ -1.632e-6■■■■□ 20
PCBP1Q15365 C6orf136-204ENST00000446773 1496 ntTSL 1 (best)20.94■□□□□ 0.942e-7■■■■□ 20
PCBP1Q15365 SUZ12P1-201ENST00000497969 886 ntTSL 1 (best)27.5■■□□□ 1.991e-17■■■■□ 20
PCBP1Q15365 SUZ12P1-204ENST00000579526 563 ntTSL 223.81■■□□□ 1.41e-17■■■■□ 20
PCBP1Q15365 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.391e-17■■■■□ 20
PCBP1Q15365 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.539e-7■■■■□ 20
PCBP1Q15365 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.019e-7■■■■□ 20
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