Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTMR3Q13615 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MTMR3Q13615 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
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