Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EIF4EBP1Q13541 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EIF4EBP1Q13541 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EIF4EBP1Q13541 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
EIF4EBP1Q13541 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EIF4EBP1Q13541 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EIF4EBP1Q13541 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EIF4EBP1Q13541 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EIF4EBP1Q13541 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EIF4EBP1Q13541 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EIF4EBP1Q13541 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EIF4EBP1Q13541 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EIF4EBP1Q13541 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EIF4EBP1Q13541 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EIF4EBP1Q13541 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EIF4EBP1Q13541 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EIF4EBP1Q13541 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EIF4EBP1Q13541 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms