Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF4BQ13523 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF4BQ13523 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms