Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms