Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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