Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SP140Q13342 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SP140Q13342 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SP140Q13342 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SP140Q13342 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SP140Q13342 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SP140Q13342 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SP140Q13342 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SP140Q13342 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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SP140Q13342 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SP140Q13342 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SP140Q13342 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SP140Q13342 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SP140Q13342 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SP140Q13342 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SP140Q13342 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SP140Q13342 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SP140Q13342 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SP140Q13342 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SP140Q13342 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SP140Q13342 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SP140Q13342 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SP140Q13342 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SP140Q13342 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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SP140Q13342 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SP140Q13342 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SP140Q13342 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SP140Q13342 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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SP140Q13342 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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SP140Q13342 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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SP140Q13342 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SP140Q13342 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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SP140Q13342 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SP140Q13342 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SP140Q13342 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SP140Q13342 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SP140Q13342 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SP140Q13342 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SP140Q13342 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SP140Q13342 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SP140Q13342 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SP140Q13342 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SP140Q13342 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SP140Q13342 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SP140Q13342 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SP140Q13342 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SP140Q13342 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SP140Q13342 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SP140Q13342 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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