Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC33.79■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC33.79■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC33.78■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC33.78■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC33.77■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC33.76■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
GRIN2BQ13224 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GRIN2BQ13224 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
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