Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKAA1Q13131 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PRKAA1Q13131 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRKAA1Q13131 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRKAA1Q13131 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKAA1Q13131 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKAA1Q13131 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKAA1Q13131 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKAA1Q13131 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKAA1Q13131 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKAA1Q13131 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms