Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
IFT88Q13099 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFT88Q13099 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFT88Q13099 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFT88Q13099 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IFT88Q13099 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
IFT88Q13099 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFT88Q13099 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFT88Q13099 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFT88Q13099 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFT88Q13099 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFT88Q13099 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
IFT88Q13099 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFT88Q13099 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFT88Q13099 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFT88Q13099 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFT88Q13099 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFT88Q13099 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFT88Q13099 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IFT88Q13099 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IFT88Q13099 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IFT88Q13099 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IFT88Q13099 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IFT88Q13099 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IFT88Q13099 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IFT88Q13099 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IFT88Q13099 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IFT88Q13099 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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IFT88Q13099 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IFT88Q13099 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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IFT88Q13099 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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IFT88Q13099 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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IFT88Q13099 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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IFT88Q13099 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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IFT88Q13099 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
IFT88Q13099 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
IFT88Q13099 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
IFT88Q13099 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
IFT88Q13099 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
IFT88Q13099 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
IFT88Q13099 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
IFT88Q13099 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFT88Q13099 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFT88Q13099 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFT88Q13099 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFT88Q13099 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFT88Q13099 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFT88Q13099 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFT88Q13099 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFT88Q13099 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFT88Q13099 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFT88Q13099 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFT88Q13099 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFT88Q13099 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFT88Q13099 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFT88Q13099 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFT88Q13099 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IFT88Q13099 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
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