Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CSTF3Q12996 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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