Protein–RNA interactions for Protein: Q12468

RRI1, COP9 signalosome complex subunit 5, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRI1Q12468 BOI1YBL085W 2943 nt2.58□□□□□ -2
RRI1Q12468 RPS17BYDR447C 411 nt2.58□□□□□ -2
RRI1Q12468 URM1YIL008W 300 nt2.58□□□□□ -2
RRI1Q12468 YIL058WYIL058W 285 nt2.58□□□□□ -2
RRI1Q12468 PRE8YML092C 753 nt2.58□□□□□ -2
RRI1Q12468 HEH2YDR458C 1992 nt2.58□□□□□ -2
RRI1Q12468 ECM5YMR176W 4236 nt2.57□□□□□ -2
RRI1Q12468 UTP14YML093W 2700 nt2.57□□□□□ -2
RRI1Q12468 GYP7YDL234C 2241 nt2.57□□□□□ -2
RRI1Q12468 YDR413CYDR413C 576 nt2.57□□□□□ -2
RRI1Q12468 APC9YLR102C 798 nt2.57□□□□□ -2
RRI1Q12468 AIM32YML050W 936 nt2.57□□□□□ -2
RRI1Q12468 ESF2YNR054C 951 nt2.57□□□□□ -2
RRI1Q12468 ATP15YPL271W 189 nt2.57□□□□□ -2
RRI1Q12468 ROG1YGL144C 2058 nt2.57□□□□□ -2
RRI1Q12468 YCR022CYCR022C 345 nt2.56□□□□□ -2
RRI1Q12468 SDC1YDR469W 528 nt2.56□□□□□ -2
RRI1Q12468 YER097WYER097W 330 nt2.56□□□□□ -2
RRI1Q12468 NCE101YJL205C 162 nt2.56□□□□□ -2
RRI1Q12468 TLC1TLC1 1301 nt2.56□□□□□ -2
RRI1Q12468 PFF1YBR074W 2931 nt2.55□□□□□ -2
RRI1Q12468 JSN1YJR091C 3276 nt2.55□□□□□ -2
RRI1Q12468 COX1Q0045 1605 nt2.55□□□□□ -2
RRI1Q12468 YGR067CYGR067C 2415 nt2.55□□□□□ -2
RRI1Q12468 YHR078WYHR078W 1659 nt2.55□□□□□ -2
RRI1Q12468 SMA2YML066C 1110 nt2.55□□□□□ -2
RRI1Q12468 COX7YMR256C 183 nt2.55□□□□□ -2
RRI1Q12468 ATP3YBR039W 936 nt2.55□□□□□ -2
RRI1Q12468 RPL33AYPL143W 324 nt2.55□□□□□ -2
RRI1Q12468 FUS1YCL027W 1539 nt2.55□□□□□ -2
RRI1Q12468 SOK1YDR006C 2706 nt2.55□□□□□ -2
RRI1Q12468 TPS2YDR074W 2691 nt2.55□□□□□ -2
RRI1Q12468 YME2YMR302C 2553 nt2.55□□□□□ -2
RRI1Q12468 MET6YER091C 2304 nt2.54□□□□□ -2
RRI1Q12468 GEA1YJR031C 4227 nt2.54□□□□□ -2
RRI1Q12468 SWT1YOR166C 1377 nt2.54□□□□□ -2
RRI1Q12468 LEU3YLR451W 2661 nt2.54□□□□□ -2
RRI1Q12468 PAU14YIL176C 363 nt2.54□□□□□ -2
RRI1Q12468 HYR1YIR037W 492 nt2.54□□□□□ -2
RRI1Q12468 PAU1YJL223C 363 nt2.54□□□□□ -2
RRI1Q12468 YKR033CYKR033C 426 nt2.54□□□□□ -2
RRI1Q12468 YAR053WYAR053W 297 nt2.54□□□□□ -2
RRI1Q12468 TIM18YOR297C 579 nt2.54□□□□□ -2
RRI1Q12468 NUP82YJL061W 2142 nt2.54□□□□□ -2
RRI1Q12468 YJL016WYJL016W 1686 nt2.53□□□□□ -2
RRI1Q12468 FLO11YIR019C 4104 nt2.53□□□□□ -2
RRI1Q12468 YPK1YKL126W 2043 nt2.53□□□□□ -2
RRI1Q12468 ILS1YBL076C 3219 nt2.53□□□□□ -2
RRI1Q12468 YDR102CYDR102C 333 nt2.53□□□□□ -2
RRI1Q12468 YDR366CYDR366C 399 nt2.53□□□□□ -2
RRI1Q12468 GPI14YJR013W 1212 nt2.53□□□□□ -2
RRI1Q12468 BIL1YOR304C-A 231 nt2.53□□□□□ -2
RRI1Q12468 ESC1YMR219W 4977 nt2.53□□□□□ -2
RRI1Q12468 YIL166CYIL166C 1629 nt2.53□□□□□ -2
RRI1Q12468 VPS52YDR484W 1926 nt2.52□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 SAP1YER047C 2694 nt2.52□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 YDR250CYDR250C 276 nt2.52□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 TIM11YDR322C-A 291 nt2.52□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.52□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 RPL23BYER117W 414 nt2.52□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 MSL1YIR009W 336 nt2.52□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 YJL202CYJL202C 348 nt2.52□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 YKL083WYKL083W 615 nt2.52□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 YLR012CYLR012C 300 nt2.52□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 ROX1YPR065W 1107 nt2.52□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 BRO1YPL084W 2535 nt2.52□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 SKT5YBL061C 2091 nt2.52□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 RLF2YPR018W 1821 nt2.52□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 SRB8YCR081W 4284 nt2.51□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 SSN2YDR443C 4263 nt2.51□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 APC2YLR127C 2562 nt2.51□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 snR65snR65 100 nt2.51□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 YDL041WYDL041W 354 nt2.51□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 YDR209CYDR209C 414 nt2.51□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt2.51□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 ECM21YBL101C 3354 nt2.51□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 YJL181WYJL181W 1836 nt2.51□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 YOL057WYOL057W 2136 nt2.51□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 SSE1YPL106C 2082 nt2.51□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 TCB2YNL087W 3537 nt2.51□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 SIN3YOL004W 4611 nt2.51□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 SPB1YCL054W 2526 nt2.5□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 ECM25YJL201W 1800 nt2.5□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 SUL1YBR294W 2580 nt2.5□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 ADK1YDR226W 669 nt2.5□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 AST2YER101C 1293 nt2.5□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.5□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 RPL8BYLL045C 771 nt2.5□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 NUM1YDR150W 8247 nt2.5□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 YPL216WYPL216W 3309 nt2.49□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 NPR3YHL023C 3441 nt2.49□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 YDR193WYDR193W 399 nt2.49□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 YFL032WYFL032W 321 nt2.49□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 YFR056CYFR056C 369 nt2.49□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 RPS22AYJL190C 393 nt2.49□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 TMA22YJR014W 597 nt2.49□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt2.49□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 RPL9BYNL067W 576 nt2.49□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 YOR282WYOR282W 321 nt2.49□□□□□ -2.01
RRI1Q12468 POM152YMR129W 4014 nt2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27 ms