Protein–RNA interactions for Protein: Q12455

SPE4, Spermine synthase, yeastyeast

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE4Q12455 YER006C-AYER006C-A 318 nt2.44□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 SEN15YMR059W 387 nt2.44□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 ICY1YMR195W 384 nt2.44□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 TSC3YBR058C-A 243 nt2.44□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 YPL276WYPL276W 438 nt2.44□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 TOP2YNL088W 4287 nt2.44□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 GIS1YDR096W 2685 nt2.44□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 PHO91YNR013C 2685 nt2.44□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 EDS1YBR033W 2760 nt2.44□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 HMLALPHA2YCL067C 633 nt2.43□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 MATALPHA2YCR039C 633 nt2.43□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 FMP16YDR070C 282 nt2.43□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 YFL019CYFL019C 354 nt2.43□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.43□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.43□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.43□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.43□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.43□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.43□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 RPS29AYLR388W 171 nt2.43□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 CCW14YLR390W-A 717 nt2.43□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 KTI11YBL071W-A 249 nt2.43□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 RPB5YBR154C 648 nt2.43□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 YJL016WYJL016W 1686 nt2.43□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 INP51YIL002C 2841 nt2.43□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 SUL1YBR294W 2580 nt2.43□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 YEL043WYEL043W 2871 nt2.43□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 RNH70YGR276C 1662 nt2.42□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 GDS1YOR355W 1569 nt2.42□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.42□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 SDC1YDR469W 528 nt2.42□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 MZM1YDR493W 372 nt2.42□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 YFR056CYFR056C 369 nt2.42□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 RPC10YHR143W-A 213 nt2.42□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 NBL1YHR199C-A 222 nt2.42□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.42□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.42□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 YAR068WYAR068W 486 nt2.42□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 YLR269CYLR269C 351 nt2.42□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 RRT1YBL048W 312 nt2.42□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 YOR248WYOR248W 303 nt2.42□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 YPR177CYPR177C 372 nt2.42□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 FAR11YNL127W 2862 nt2.42□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 NCL1YBL024W 2055 nt2.41□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 NFT1YKR103W 3657 nt2.41□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 YCR064CYCR064C 411 nt2.41□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 GET1YGL020C 708 nt2.41□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 PRE8YML092C 753 nt2.41□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 FYV12YOR183W 390 nt2.41□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 PRM3YPL192C 402 nt2.41□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 MSB1YOR188W 3414 nt2.41□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 RGA2YDR379W 3030 nt2.41□□□□□ -2.02
SPE4Q12455 PSD2YGR170W 3417 nt2.4□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 RRP6YOR001W 2202 nt2.4□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.4□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.4□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 RPL40AYIL148W 387 nt2.4□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 NUP82YJL061W 2142 nt2.4□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 YLR031WYLR031W 561 nt2.4□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 REV1YOR346W 2958 nt2.4□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 ATP15YPL271W 189 nt2.4□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 DNA2YHR164C 4569 nt2.4□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 SCD5YOR329C 2619 nt2.4□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 SLN1YIL147C 3663 nt2.39□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 YKU80YMR106C 1890 nt2.39□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 ATP17YDR377W 306 nt2.39□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 PEX4YGR133W 552 nt2.39□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 AYR1YIL124W 894 nt2.39□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 IRC19YLL033W 693 nt2.39□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 YLR101CYLR101C 396 nt2.39□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 YBR277CYBR277C 402 nt2.39□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 YJL181WYJL181W 1836 nt2.39□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 YSW1YBR148W 1830 nt2.39□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 OSW7YFR039C 1533 nt2.38□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 YEF3YLR249W 3135 nt2.38□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 TWF1YGR080W 999 nt2.38□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 MSL5YLR116W 1431 nt2.38□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 SOK2YMR016C 2358 nt2.38□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 SGM1YJR134C 2124 nt2.38□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 PDR11YIL013C 4236 nt2.37□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 YOL098CYOL098C 3114 nt2.37□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 TAE2YPL009C 3117 nt2.37□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 MSS11YMR164C 2277 nt2.37□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 SHE2YKL130C 741 nt2.37□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 YPR039WYPR039W 336 nt2.37□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 ISW1YBR245C 3390 nt2.37□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 SNX41YDR425W 1878 nt2.37□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 ORC2YBR060C 1863 nt2.37□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 EMC6YLL014W 327 nt2.36□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt2.36□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 TIF11YMR260C 462 nt2.36□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 YMR320WYMR320W 306 nt2.36□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 TRS130YMR218C 3309 nt2.36□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 TRA1YHR099W 11235 nt2.36□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 KAP123YER110C 3342 nt2.35□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 TMN3YER113C 2121 nt2.35□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 CBF2YGR140W 2871 nt2.35□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 NUP100YKL068W 2880 nt2.35□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 YDR114CYDR114C 303 nt2.35□□□□□ -2.03
SPE4Q12455 YDR250CYDR250C 276 nt2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 294 ms