Protein–RNA interactions for Protein: Q12347

HRT3, F-box protein HRT3, yeastyeast

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRT3Q12347 SMY2YBR172C 2223 nt2.31□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 AVT2YEL064C 1443 nt2.31□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 ISW1YBR245C 3390 nt2.31□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 CLN3YAL040C 1743 nt2.31□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 GLC7YER133W 939 nt2.3□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 IRC19YLL033W 693 nt2.3□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 CDC123YLR215C 1083 nt2.3□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 YBR012CYBR012C 420 nt2.3□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 YOR392WYOR392W 444 nt2.3□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.3□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.3□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.3□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 UTP13YLR222C 2454 nt2.3□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 ATG11YPR049C 3537 nt2.3□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 BOI1YBL085W 2943 nt2.29□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 IRC8YJL051W 2469 nt2.29□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 PES4YFR023W 1836 nt2.29□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 BIT61YJL058C 1632 nt2.29□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.29□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 ATG31YDR022C 591 nt2.29□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 GCN4YEL009C 846 nt2.29□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 RNR4YGR180C 1038 nt2.29□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 NBL1YHR199C-A 222 nt2.29□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 HSP10YOR020C 321 nt2.29□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 YPL039WYPL039W 951 nt2.29□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 YPR014CYPR014C 330 nt2.29□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 YBR285WYBR285W 435 nt2.29□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 ATP22YDR350C 2055 nt2.29□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 BRP1YGL007W 378 nt2.28□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 RAD6YGL058W 519 nt2.28□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 YBR032WYBR032W 303 nt2.28□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 SSE1YPL106C 2082 nt2.28□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 TOP2YNL088W 4287 nt2.28□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 SAK1YER129W 3429 nt2.28□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 DNF1YER166W 4716 nt2.28□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 TAE2YPL009C 3117 nt2.28□□□□□ -2.04
HRT3Q12347 PHO2YDL106C 1680 nt2.28□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 UTP22YGR090W 3714 nt2.27□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 DAS1YJL149W 1992 nt2.27□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 TRZ1YKR079C 2517 nt2.27□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt2.27□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 YNL058CYNL058C 951 nt2.27□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 YOR053WYOR053W 342 nt2.27□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 YPL080CYPL080C 327 nt2.27□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 VMA9YCL005W-A 222 nt2.27□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 GPI17YDR434W 1605 nt2.27□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt2.26□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 BFR1YOR198C 1413 nt2.26□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.26□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 FPR1YNL135C 345 nt2.26□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 PEX17YNL214W 600 nt2.26□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 ISU1YPL135W 498 nt2.26□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 ORC2YBR060C 1863 nt2.26□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 SNF12YNR023W 1701 nt2.25□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 ALK2YBL009W 2031 nt2.25□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 SAP185YJL098W 3177 nt2.25□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 TFC3YAL001C 3483 nt2.25□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 RPL29YFR032C-A 180 nt2.25□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 EMP24YGL200C 612 nt2.25□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt2.25□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.25□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 YLR287CYLR287C 1068 nt2.25□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 YOL134CYOL134C 390 nt2.25□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 IRA2YOL081W 9240 nt2.25□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 RNH70YGR276C 1662 nt2.25□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 YJR079WYJR079W 330 nt2.24□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 TEN1YLR010C 483 nt2.24□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 RPS22BYLR367W 393 nt2.24□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 TSC3YBR058C-A 243 nt2.24□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 YPL197CYPL197C 414 nt2.24□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 GPX2YBR244W 489 nt2.24□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 FAR11YNL127W 2862 nt2.24□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 TFB1YDR311W 1929 nt2.24□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 YOL057WYOL057W 2136 nt2.24□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 DUG2YBR281C 2637 nt2.23□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 IRC4YDR540C 540 nt2.23□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 YER068C-AYER068C-A 432 nt2.23□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 YBT1YLL048C 4986 nt2.23□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 YPK1YKL126W 2043 nt2.22□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 YGL165CYGL165C 579 nt2.22□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 RRF1YHR038W 693 nt2.22□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 YJR023CYJR023C 402 nt2.22□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 YLR255CYLR255C 354 nt2.22□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 SEC22YLR268W 645 nt2.22□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 SWM2YNR004W 441 nt2.22□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 snR191snR191 274 nt2.22□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 FIR1YER032W 2631 nt2.22□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 SEN54YPL083C 1404 nt2.22□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 HRD3YLR207W 2502 nt2.22□□□□□ -2.05
HRT3Q12347 TPS2YDR074W 2691 nt2.21□□□□□ -2.06
HRT3Q12347 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.21□□□□□ -2.06
HRT3Q12347 TIF35YDR429C 825 nt2.21□□□□□ -2.06
HRT3Q12347 HIT1YJR055W 495 nt2.21□□□□□ -2.06
HRT3Q12347 RPL37AYLR185W 267 nt2.21□□□□□ -2.06
HRT3Q12347 SIP18YMR175W 240 nt2.21□□□□□ -2.06
HRT3Q12347 TOR1YJR066W 7413 nt2.21□□□□□ -2.06
HRT3Q12347 TOF1YNL273W 3717 nt2.2□□□□□ -2.06
HRT3Q12347 DPB11YJL090C 2295 nt2.2□□□□□ -2.06
HRT3Q12347 RLI1YDR091C 1827 nt2.2□□□□□ -2.06
HRT3Q12347 TIM11YDR322C-A 291 nt2.2□□□□□ -2.06
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