Protein–RNA interactions for Protein: Q12218

TIR4, Cell wall protein TIR4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TIR4Q12218 NDD1YOR372C 1665 nt1.92□□□□□ -2.1
TIR4Q12218 UFD4YKL010C 4452 nt1.92□□□□□ -2.1
TIR4Q12218 HSC82YMR186W 2118 nt1.91□□□□□ -2.1
TIR4Q12218 PDR3YBL005W 2931 nt1.91□□□□□ -2.1
TIR4Q12218 YJL070CYJL070C 2667 nt1.91□□□□□ -2.1
TIR4Q12218 YER084W-AYER084W-A 513 nt1.91□□□□□ -2.1
TIR4Q12218 BI2Q0110 1272 nt1.91□□□□□ -2.1
TIR4Q12218 TWF1YGR080W 999 nt1.91□□□□□ -2.1
TIR4Q12218 RNR4YGR180C 1038 nt1.91□□□□□ -2.1
TIR4Q12218 RMP1YLR145W 606 nt1.91□□□□□ -2.1
TIR4Q12218 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt1.91□□□□□ -2.1
TIR4Q12218 TOM22YNL131W 459 nt1.91□□□□□ -2.1
TIR4Q12218 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt1.91□□□□□ -2.1
TIR4Q12218 SNU114YKL173W 3027 nt1.91□□□□□ -2.1
TIR4Q12218 BRE1YDL074C 2103 nt1.91□□□□□ -2.1
TIR4Q12218 USO1YDL058W 5373 nt1.91□□□□□ -2.1
TIR4Q12218 SSE1YPL106C 2082 nt1.9□□□□□ -2.1
TIR4Q12218 DNA2YHR164C 4569 nt1.9□□□□□ -2.1
TIR4Q12218 RGA1YOR127W 3024 nt1.9□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 YPS5YGL259W 498 nt1.9□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 ECL1YGR146C 636 nt1.9□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 RNP1YLL046C 750 nt1.9□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 CMS1YLR003C 876 nt1.9□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 YML108WYML108W 318 nt1.9□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt1.9□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 YPL197CYPL197C 414 nt1.9□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 snR41snR41 95 nt1.9□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 YIL080WYIL080W 4722 nt1.9□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 SCP160YJL080C 3669 nt1.89□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 ECM25YJL201W 1800 nt1.89□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 SAP190YKR028W 3102 nt1.89□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 TAE2YPL009C 3117 nt1.89□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 JIP5YPR169W 1479 nt1.89□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 YFR016CYFR016C 3702 nt1.89□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 YPR089WYPR089W 2667 nt1.89□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 PSO2YMR137C 1986 nt1.89□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 KSP1YHR082C 3090 nt1.89□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 MDM32YOR147W 1869 nt1.89□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 UBR1YGR184C 5853 nt1.89□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 YRB1YDR002W 606 nt1.89□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 GPI8YDR331W 1236 nt1.89□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 GCN4YEL009C 846 nt1.89□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 YFL019CYFL019C 354 nt1.89□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 YIL058WYIL058W 285 nt1.89□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 TPM2YIL138C 486 nt1.89□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 PEP8YJL053W 1140 nt1.89□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 YKL202WYKL202W 582 nt1.89□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt1.89□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 URA10YMR271C 684 nt1.89□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 RPB11YOL005C 363 nt1.89□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 TRM7YBR061C 933 nt1.89□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 YPR177CYPR177C 372 nt1.89□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 YDR186CYDR186C 2634 nt1.89□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 HRD3YLR207W 2502 nt1.89□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 UTP22YGR090W 3714 nt1.89□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 KOG1YHR186C 4674 nt1.88□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 SLN1YIL147C 3663 nt1.88□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 snR70snR70 164 nt1.88□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 YGR042WYGR042W 816 nt1.88□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 YNL324WYNL324W 396 nt1.88□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt1.88□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 YBR197CYBR197C 654 nt1.88□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 KAP123YER110C 3342 nt1.88□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt1.88□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 MUD2YKL074C 1584 nt1.88□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 INP51YIL002C 2841 nt1.88□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 SSY1YDR160W 2559 nt1.88□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 SMC6YLR383W 3345 nt1.87□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 ACB1YGR037C 264 nt1.87□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 HYR1YIR037W 492 nt1.87□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 SPE1YKL184W 1401 nt1.87□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 AIM29YKR074W 468 nt1.87□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 ALK2YBL009W 2031 nt1.87□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 RRT1YBL048W 312 nt1.87□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 UBP2YOR124C 3819 nt1.87□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 RPB5YBR154C 648 nt1.87□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 snR43snR43 209 nt1.87□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 snR54snR54 86 nt1.87□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 PPN1YDR452W 2025 nt1.86□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 YFH1YDL120W 525 nt1.86□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 AAD16YFL057C 459 nt1.86□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 YGL165CYGL165C 579 nt1.86□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt1.86□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 YKL111CYKL111C 336 nt1.86□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 TOR2YKL203C 7425 nt1.86□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 GDS1YOR355W 1569 nt1.85□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 VPS16YPL045W 2397 nt1.85□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 PES4YFR023W 1836 nt1.85□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 YJR079WYJR079W 330 nt1.85□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 YKL063CYKL063C 504 nt1.85□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 PAU8YAL068C 363 nt1.85□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt1.85□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 RPS7BYNL096C 573 nt1.85□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 PAU20YOL161C 363 nt1.85□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 APL5YPL195W 2799 nt1.85□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 HMLALPHA2YCL067C 633 nt1.84□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 MATALPHA2YCR039C 633 nt1.84□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 YDL032WYDL032W 312 nt1.84□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 CAJ1YER048C 1176 nt1.84□□□□□ -2.11
TIR4Q12218 YHR125WYHR125W 306 nt1.84□□□□□ -2.11
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