Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 FRT2YAL028W 1587 nt4.34□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 ETP1YHL010C 1758 nt4.34□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 MUK1YPL070W 1839 nt4.34□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 SRP72YPL210C 1923 nt4.34□□□□□ -1.71
TFB4Q12004 LEU3YLR451W 2661 nt4.34□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 SNF2YOR290C 5112 nt4.33□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 KGD1YIL125W 3045 nt4.33□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 MSR1YHR091C 1932 nt4.33□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 SNA2YDR525W-A 240 nt4.33□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt4.33□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 TRX1YLR043C 312 nt4.33□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 RPS17AYML024W 411 nt4.33□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 MCD4YKL165C 2760 nt4.33□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 SAP4YGL229C 2457 nt4.32□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 QCR7YDR529C 384 nt4.32□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt4.32□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt4.32□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt4.32□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt4.32□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 MSD1YPL104W 1977 nt4.32□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 YPR003CYPR003C 2265 nt4.32□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 IPT1YDR072C 1584 nt4.31□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 TAF5YBR198C 2397 nt4.31□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 YPK9YOR291W 4419 nt4.31□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 PMP1YCR024C-A 123 nt4.31□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt4.31□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 PMP2YEL017C-A 132 nt4.31□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 SWC7YLR385C 399 nt4.31□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 NUP2YLR335W 2163 nt4.31□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 YDL176WYDL176W 2127 nt4.31□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 SPB1YCL054W 2526 nt4.31□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 PIM1YBL022C 3402 nt4.3□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 ASG1YIL130W 2895 nt4.3□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 SKT5YBL061C 2091 nt4.3□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 COA3YJL062W-A 258 nt4.3□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 YMR324CYMR324C 243 nt4.3□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt4.3□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 YOL057WYOL057W 2136 nt4.3□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 ECM22YLR228C 2445 nt4.3□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 NSP1YJL041W 2472 nt4.29□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 GAL11YOL051W 3246 nt4.29□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 SWI1YPL016W 3945 nt4.28□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 AKL1YBR059C 3327 nt4.28□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 SBH1YER087C-B 249 nt4.28□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 RPL20BYOR312C 519 nt4.28□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 PEX1YKL197C 3132 nt4.28□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 POL1YNL102W 4407 nt4.28□□□□□ -1.72
TFB4Q12004 NPR1YNL183C 2373 nt4.27□□□□□ -1.73
TFB4Q12004 GIS2YNL255C 462 nt4.27□□□□□ -1.73
TFB4Q12004 snR191snR191 274 nt4.27□□□□□ -1.73
TFB4Q12004 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt4.27□□□□□ -1.73
TFB4Q12004 VTC4YJL012C 2166 nt4.26□□□□□ -1.73
TFB4Q12004 SPO21YOL091W 1830 nt4.26□□□□□ -1.73
TFB4Q12004 SIP3YNL257C 3690 nt4.26□□□□□ -1.73
TFB4Q12004 COX23YHR116W 456 nt4.26□□□□□ -1.73
TFB4Q12004 PEP5YMR231W 3090 nt4.26□□□□□ -1.73
TFB4Q12004 RPO21YDL140C 5202 nt4.26□□□□□ -1.73
TFB4Q12004 FOX2YKR009C 2703 nt4.26□□□□□ -1.73
TFB4Q12004 CAF130YGR134W 3369 nt4.26□□□□□ -1.73
TFB4Q12004 DFG16YOR030W 1860 nt4.26□□□□□ -1.73
TFB4Q12004 VID27YNL212W 2349 nt4.26□□□□□ -1.73
TFB4Q12004 MIS1YBR084W 2928 nt4.25□□□□□ -1.73
TFB4Q12004 YGL069CYGL069C 465 nt4.25□□□□□ -1.73
TFB4Q12004 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt4.25□□□□□ -1.73
TFB4Q12004 FPR1YNL135C 345 nt4.25□□□□□ -1.73
TFB4Q12004 LSM7YNL147W 348 nt4.25□□□□□ -1.73
TFB4Q12004 SPT21YMR179W 2277 nt4.25□□□□□ -1.73
TFB4Q12004 SNU114YKL173W 3027 nt4.24□□□□□ -1.73
TFB4Q12004 HSC82YMR186W 2118 nt4.24□□□□□ -1.73
TFB4Q12004 YLR416CYLR416C 399 nt4.24□□□□□ -1.73
TFB4Q12004 snR7-SsnR7-S 179 nt4.23□□□□□ -1.73
TFB4Q12004 RPS17BYDR447C 411 nt4.23□□□□□ -1.73
TFB4Q12004 TMN3YER113C 2121 nt4.23□□□□□ -1.73
TFB4Q12004 LSO2YGR169C-A 279 nt4.23□□□□□ -1.73
TFB4Q12004 CDC20YGL116W 1833 nt4.23□□□□□ -1.73
TFB4Q12004 CIN1YOR349W 3045 nt4.22□□□□□ -1.73
TFB4Q12004 RPL33BYOR234C 324 nt4.22□□□□□ -1.73
TFB4Q12004 RLM1YPL089C 2031 nt4.22□□□□□ -1.73
TFB4Q12004 KIN2YLR096W 3444 nt4.22□□□□□ -1.73
TFB4Q12004 MNN4YKL201C 3537 nt4.22□□□□□ -1.73
TFB4Q12004 PIG1YLR273C 1947 nt4.21□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt4.21□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 YGL024WYGL024W 336 nt4.21□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 ECM12YHR021W-A 456 nt4.21□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 GPI13YLL031C 3054 nt4.21□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 IOC2YLR095C 2439 nt4.21□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 SLM2YNL047C 1971 nt4.2□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 snR61snR61 90 nt4.2□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 PRE4YFR050C 801 nt4.2□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 USE1YGL098W 738 nt4.2□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 RSM19YNR037C 276 nt4.2□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 RPS23BYPR132W 438 nt4.2□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 MET4YNL103W 2019 nt4.19□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 PMC1YGL006W 3522 nt4.19□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 KAR3YPR141C 2190 nt4.19□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 YDR193WYDR193W 399 nt4.19□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt4.19□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 PWP2YCR057C 2772 nt4.19□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 FLO8YER109C 2400 nt4.19□□□□□ -1.74
TFB4Q12004 ATG2YNL242W 4779 nt4.18□□□□□ -1.74
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