Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAGPQ0VAQ4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAGPQ0VAQ4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAGPQ0VAQ4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAGPQ0VAQ4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAGPQ0VAQ4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAGPQ0VAQ4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAGPQ0VAQ4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAGPQ0VAQ4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAGPQ0VAQ4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAGPQ0VAQ4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAGPQ0VAQ4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAGPQ0VAQ4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAGPQ0VAQ4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAGPQ0VAQ4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAGPQ0VAQ4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAGPQ0VAQ4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAGPQ0VAQ4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAGPQ0VAQ4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAGPQ0VAQ4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAGPQ0VAQ4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAGPQ0VAQ4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAGPQ0VAQ4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAGPQ0VAQ4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAGPQ0VAQ4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAGPQ0VAQ4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAGPQ0VAQ4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAGPQ0VAQ4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SMAGPQ0VAQ4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SMAGPQ0VAQ4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAGPQ0VAQ4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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