Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RIPPLY1Q0D2K3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms