Protein–RNA interactions for Protein: Q08773

ISW2, ISWI chromatin-remodeling complex ATPase ISW2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ISW2Q08773 PTC5YOR090C 1719 nt6.08□□□□□ -1.44
ISW2Q08773 YGR237CYGR237C 2358 nt6.07□□□□□ -1.44
ISW2Q08773 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt6.07□□□□□ -1.44
ISW2Q08773 YMR324CYMR324C 243 nt6.07□□□□□ -1.44
ISW2Q08773 LCL1YPL056C 306 nt6.07□□□□□ -1.44
ISW2Q08773 VTC4YJL012C 2166 nt6.07□□□□□ -1.44
ISW2Q08773 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt6.06□□□□□ -1.44
ISW2Q08773 YBL065WYBL065W 345 nt6.05□□□□□ -1.44
ISW2Q08773 HSP104YLL026W 2727 nt6.05□□□□□ -1.44
ISW2Q08773 CYK3YDL117W 2658 nt6.05□□□□□ -1.44
ISW2Q08773 ALK2YBL009W 2031 nt6.04□□□□□ -1.44
ISW2Q08773 ROD1YOR018W 2514 nt6.04□□□□□ -1.44
ISW2Q08773 CDC20YGL116W 1833 nt6.04□□□□□ -1.44
ISW2Q08773 KIC1YHR102W 3243 nt6.04□□□□□ -1.44
ISW2Q08773 YER039C-AYER039C-A 219 nt6.04□□□□□ -1.44
ISW2Q08773 OAF3YKR064W 2592 nt6.04□□□□□ -1.44
ISW2Q08773 SKG6YHR149C 2205 nt6.03□□□□□ -1.44
ISW2Q08773 HPF1YOL155C 2904 nt6.03□□□□□ -1.44
ISW2Q08773 EFR3YMR212C 2349 nt6.03□□□□□ -1.44
ISW2Q08773 PDR8YLR266C 2106 nt6.02□□□□□ -1.45
ISW2Q08773 TAF6YGL112C 1551 nt6.01□□□□□ -1.45
ISW2Q08773 FRE3YOR381W 2136 nt6.01□□□□□ -1.45
ISW2Q08773 KRS1YDR037W 1776 nt6.01□□□□□ -1.45
ISW2Q08773 HYP2YEL034W 474 nt6□□□□□ -1.45
ISW2Q08773 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt6□□□□□ -1.45
ISW2Q08773 PHD1YKL043W 1101 nt6□□□□□ -1.45
ISW2Q08773 ECM5YMR176W 4236 nt6□□□□□ -1.45
ISW2Q08773 FIG4YNL325C 2640 nt6□□□□□ -1.45
ISW2Q08773 KEX1YGL203C 2190 nt6□□□□□ -1.45
ISW2Q08773 FOL1YNL256W 2475 nt6□□□□□ -1.45
ISW2Q08773 TGL4YKR089C 2733 nt5.99□□□□□ -1.45
ISW2Q08773 YPR003CYPR003C 2265 nt5.99□□□□□ -1.45
ISW2Q08773 PDC1YLR044C 1692 nt5.99□□□□□ -1.45
ISW2Q08773 SOD1YJR104C 465 nt5.99□□□□□ -1.45
ISW2Q08773 ECM16YMR128W 3804 nt5.99□□□□□ -1.45
ISW2Q08773 INP2YMR163C 2118 nt5.99□□□□□ -1.45
ISW2Q08773 KIP2YPL155C 2121 nt5.99□□□□□ -1.45
ISW2Q08773 REC8YPR007C 2043 nt5.99□□□□□ -1.45
ISW2Q08773 VID28YIL017C 2766 nt5.98□□□□□ -1.45
ISW2Q08773 SKT5YBL061C 2091 nt5.97□□□□□ -1.45
ISW2Q08773 ISW2YOR304W 3363 nt5.97□□□□□ -1.45
ISW2Q08773 GDH2YDL215C 3279 nt5.97□□□□□ -1.45
ISW2Q08773 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt5.96□□□□□ -1.46
ISW2Q08773 NUP2YLR335W 2163 nt5.96□□□□□ -1.46
ISW2Q08773 PUF4YGL014W 2667 nt5.95□□□□□ -1.46
ISW2Q08773 YDL176WYDL176W 2127 nt5.95□□□□□ -1.46
ISW2Q08773 COG3YER157W 2406 nt5.95□□□□□ -1.46
ISW2Q08773 ERB1YMR049C 2424 nt5.95□□□□□ -1.46
ISW2Q08773 DYN2YDR424C 279 nt5.95□□□□□ -1.46
ISW2Q08773 ERG7YHR072W 2196 nt5.95□□□□□ -1.46
ISW2Q08773 SPO75YLL005C 2607 nt5.95□□□□□ -1.46
ISW2Q08773 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt5.95□□□□□ -1.46
ISW2Q08773 PSE1YMR308C 3270 nt5.95□□□□□ -1.46
ISW2Q08773 CHL1YPL008W 2586 nt5.95□□□□□ -1.46
ISW2Q08773 NUP120YKL057C 3114 nt5.94□□□□□ -1.46
ISW2Q08773 DOT6YER088C 2013 nt5.94□□□□□ -1.46
ISW2Q08773 RSC3YDR303C 2658 nt5.94□□□□□ -1.46
ISW2Q08773 KAP104YBR017C 2757 nt5.94□□□□□ -1.46
ISW2Q08773 MPS1YDL028C 2295 nt5.94□□□□□ -1.46
ISW2Q08773 ATG13YPR185W 2217 nt5.93□□□□□ -1.46
ISW2Q08773 NAG1YGR031C-A 492 nt5.93□□□□□ -1.46
ISW2Q08773 LSO2YGR169C-A 279 nt5.93□□□□□ -1.46
ISW2Q08773 GAL10YBR019C 2100 nt5.93□□□□□ -1.46
ISW2Q08773 VID30YGL227W 2877 nt5.92□□□□□ -1.46
ISW2Q08773 LEU3YLR451W 2661 nt5.92□□□□□ -1.46
ISW2Q08773 AXL2YIL140W 2472 nt5.92□□□□□ -1.46
ISW2Q08773 AVT1YJR001W 1809 nt5.92□□□□□ -1.46
ISW2Q08773 GLN4YOR168W 2430 nt5.91□□□□□ -1.46
ISW2Q08773 NUP85YJR042W 2235 nt5.91□□□□□ -1.46
ISW2Q08773 UBA1YKL210W 3075 nt5.9□□□□□ -1.46
ISW2Q08773 UPC2YDR213W 2742 nt5.9□□□□□ -1.46
ISW2Q08773 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt5.9□□□□□ -1.46
ISW2Q08773 KHA1YJL094C 2622 nt5.9□□□□□ -1.47
ISW2Q08773 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt5.89□□□□□ -1.47
ISW2Q08773 YDR193WYDR193W 399 nt5.88□□□□□ -1.47
ISW2Q08773 snR17bsnR17b 332 nt5.88□□□□□ -1.47
ISW2Q08773 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt5.87□□□□□ -1.47
ISW2Q08773 CHS6YJL099W 2241 nt5.87□□□□□ -1.47
ISW2Q08773 CAT2YML042W 2013 nt5.86□□□□□ -1.47
ISW2Q08773 LYP1YNL268W 1836 nt5.86□□□□□ -1.47
ISW2Q08773 TEL1YBL088C 8364 nt5.85□□□□□ -1.47
ISW2Q08773 PBY1YBR094W 2262 nt5.85□□□□□ -1.47
ISW2Q08773 YLR296WYLR296W 327 nt5.85□□□□□ -1.47
ISW2Q08773 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt5.85□□□□□ -1.47
ISW2Q08773 GIN4YDR507C 3429 nt5.84□□□□□ -1.47
ISW2Q08773 RPS8AYBL072C 603 nt5.84□□□□□ -1.47
ISW2Q08773 COS111YBR203W 2775 nt5.84□□□□□ -1.47
ISW2Q08773 SGD1YLR336C 2700 nt5.84□□□□□ -1.47
ISW2Q08773 RRN6YBL014C 2685 nt5.83□□□□□ -1.48
ISW2Q08773 SLM2YNL047C 1971 nt5.83□□□□□ -1.48
ISW2Q08773 HUL4YJR036C 2679 nt5.82□□□□□ -1.48
ISW2Q08773 URB2YJR041C 3525 nt5.82□□□□□ -1.48
ISW2Q08773 STE13YOR219C 2796 nt5.82□□□□□ -1.48
ISW2Q08773 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt5.82□□□□□ -1.48
ISW2Q08773 RIM15YFL033C 5313 nt5.81□□□□□ -1.48
ISW2Q08773 CAF4YKR036C 1932 nt5.81□□□□□ -1.48
ISW2Q08773 HAP1YLR256W 4509 nt5.81□□□□□ -1.48
ISW2Q08773 DNF2YDR093W 4839 nt5.81□□□□□ -1.48
ISW2Q08773 YPR089WYPR089W 2667 nt5.81□□□□□ -1.48
ISW2Q08773 SRP14YDL092W 441 nt5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.7 ms