Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
GOLGA3Q08378 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
GOLGA3Q08378 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
GOLGA3Q08378 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
GOLGA3Q08378 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
GOLGA3Q08378 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
GOLGA3Q08378 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
GOLGA3Q08378 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
GOLGA3Q08378 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
GOLGA3Q08378 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
GOLGA3Q08378 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
GOLGA3Q08378 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
GOLGA3Q08378 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
GOLGA3Q08378 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
GOLGA3Q08378 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
GOLGA3Q08378 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
GOLGA3Q08378 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
GOLGA3Q08378 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
GOLGA3Q08378 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
GOLGA3Q08378 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
GOLGA3Q08378 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC33.23■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC33.23■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms