Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP3CAQ08209 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP3CAQ08209 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms