Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DEUP1Q05D60 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms