Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TNP2Q05952 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.8 ms