Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CALD1Q05682 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CALD1Q05682 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms