Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKCZQ05513 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKCZQ05513 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKCZQ05513 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKCZQ05513 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKCZQ05513 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKCZQ05513 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKCZQ05513 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKCZQ05513 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKCZQ05513 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKCZQ05513 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKCZQ05513 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKCZQ05513 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKCZQ05513 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKCZQ05513 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKCZQ05513 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKCZQ05513 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKCZQ05513 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKCZQ05513 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCZQ05513 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCZQ05513 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCZQ05513 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCZQ05513 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCZQ05513 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCZQ05513 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCZQ05513 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCZQ05513 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCZQ05513 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCZQ05513 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCZQ05513 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCZQ05513 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCZQ05513 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCZQ05513 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCZQ05513 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCZQ05513 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCZQ05513 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKCZQ05513 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms