Protein–RNA interactions for Protein: Q04712

RRN11, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN11, yeastyeast

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11Q04712 NFU1YKL040C 771 nt2.37□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 NOP15YNL110C 663 nt2.37□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt2.37□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 DNL4YOR005C 2835 nt2.36□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 AFI1YOR129C 2682 nt2.36□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt2.36□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 EDS1YBR033W 2760 nt2.36□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 YPR097WYPR097W 3222 nt2.36□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 TIM9YEL020W-A 264 nt2.36□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 YMR31YFR049W 372 nt2.36□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 YHR125WYHR125W 306 nt2.36□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt2.36□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 TMA10YLR327C 261 nt2.36□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 YOL159CYOL159C 516 nt2.36□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 KSP1YHR082C 3090 nt2.36□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 PES4YFR023W 1836 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 SPB1YCL054W 2526 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 CBS1YDL069C 690 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 IES5YER092W 378 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 RAD6YGL058W 519 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 RTS3YGR161C 792 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 RRF1YHR038W 693 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 SPC1YJR010C-A 285 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 YKL063CYKL063C 504 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 snR54snR54 86 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 PPN1YDR452W 2025 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 YJL181WYJL181W 1836 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 GPI17YDR434W 1605 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 SCP160YJL080C 3669 nt2.34□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 RTR2YDR066C 591 nt2.34□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 RPL36AYMR194W 303 nt2.34□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt2.34□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 VMA9YCL005W-A 222 nt2.34□□□□□ -2.03
RRN11Q04712 UTP13YLR222C 2454 nt2.33□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 OSW7YFR039C 1533 nt2.33□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.33□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 ATG31YDR022C 591 nt2.33□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 SWF1YDR126W 1011 nt2.33□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 TIF35YDR429C 825 nt2.33□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 RMP1YLR145W 606 nt2.33□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 CRS5YOR031W 210 nt2.33□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 HSC82YMR186W 2118 nt2.33□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 STH1YIL126W 4080 nt2.33□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 TPS2YDR074W 2691 nt2.33□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 YOL098CYOL098C 3114 nt2.33□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 RNH70YGR276C 1662 nt2.32□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 YER006C-AYER006C-A 318 nt2.32□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 SMB1YER029C 591 nt2.32□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 RPL29YFR032C-A 180 nt2.32□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 PEX4YGR133W 552 nt2.32□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 NBL1YHR199C-A 222 nt2.32□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 PEP8YJL053W 1140 nt2.32□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 YJL202CYJL202C 348 nt2.32□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 CCW14YLR390W-A 717 nt2.32□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 YML084WYML084W 309 nt2.32□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 RPS7BYNL096C 573 nt2.32□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 PEP12YOR036W 867 nt2.32□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 YPL039WYPL039W 951 nt2.32□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 ATP15YPL271W 189 nt2.32□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 YNL018CYNL018C 1839 nt2.32□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 HRD3YLR207W 2502 nt2.32□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 ARP8YOR141C 2646 nt2.32□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 INP51YIL002C 2841 nt2.32□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 UBP1YDL122W 2430 nt2.31□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.31□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 CMS1YLR003C 876 nt2.31□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 BNI1YNL271C 5862 nt2.31□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 SCD5YOR329C 2619 nt2.31□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 ROY1YMR258C 1662 nt2.31□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 GPI19YDR437W 423 nt2.3□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 IRC4YDR540C 540 nt2.3□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 AYR1YIL124W 894 nt2.3□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 YJR023CYJR023C 402 nt2.3□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 YOR248WYOR248W 303 nt2.3□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 YBR032WYBR032W 303 nt2.3□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 TMN3YER113C 2121 nt2.3□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 DPB11YJL090C 2295 nt2.3□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 PUF4YGL014W 2667 nt2.3□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 PHO91YNR013C 2685 nt2.3□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 YNL034WYNL034W 1839 nt2.29□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 snR76snR76 109 nt2.29□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 RPL27BYDR471W 411 nt2.29□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 YGL165CYGL165C 579 nt2.29□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt2.29□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 UTP30YKR060W 825 nt2.29□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 UBC7YMR022W 498 nt2.29□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 RGM1YMR182C 636 nt2.29□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 URA10YMR271C 684 nt2.29□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 YPL080CYPL080C 327 nt2.29□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 YPL197CYPL197C 414 nt2.29□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 NSL1YPL233W 651 nt2.29□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 YBR285WYBR285W 435 nt2.29□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 APL5YPL195W 2799 nt2.29□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 VPS13YLL040C 9435 nt2.28□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 PUT3YKL015W 2940 nt2.28□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 YAR047CYAR047C 321 nt2.28□□□□□ -2.04
RRN11Q04712 YBR209WYBR209W 318 nt2.28□□□□□ -2.04
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