Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUCB1Q02818 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUCB1Q02818 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms