Protein–RNA interactions for Protein: Q02539

HIST1H1A, Histone H1.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H1AQ02539 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST1H1AQ02539 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms