Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DSG1Q02413 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms