Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms