Protein–RNA interactions for Protein: Q02127

DHODH, Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHODHQ02127 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DHODHQ02127 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DHODHQ02127 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DHODHQ02127 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DHODHQ02127 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DHODHQ02127 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DHODHQ02127 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DHODHQ02127 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DHODHQ02127 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DHODHQ02127 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms