Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SATB1Q01826 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SATB1Q01826 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms