Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms