Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF2Q01130 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRSF2Q01130 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRSF2Q01130 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRSF2Q01130 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRSF2Q01130 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRSF2Q01130 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRSF2Q01130 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRSF2Q01130 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF2Q01130 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF2Q01130 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF2Q01130 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF2Q01130 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF2Q01130 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF2Q01130 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF2Q01130 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF2Q01130 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF2Q01130 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF2Q01130 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF2Q01130 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF2Q01130 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF2Q01130 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF2Q01130 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF2Q01130 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF2Q01130 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF2Q01130 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF2Q01130 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF2Q01130 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF2Q01130 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF2Q01130 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF2Q01130 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF2Q01130 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms