Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRCDQ00LT1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms