Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK17Q00537 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK17Q00537 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms