Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXC5Q00444 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms