Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2BQ00403 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms