Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD1P98174 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD1P98174 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD1P98174 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD1P98174 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD1P98174 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD1P98174 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGD1P98174 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FGD1P98174 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FGD1P98174 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FGD1P98174 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGD1P98174 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGD1P98174 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGD1P98174 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGD1P98174 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGD1P98174 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGD1P98174 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGD1P98174 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGD1P98174 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FGD1P98174 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FGD1P98174 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGD1P98174 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGD1P98174 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGD1P98174 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGD1P98174 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGD1P98174 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGD1P98174 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGD1P98174 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGD1P98174 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGD1P98174 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGD1P98174 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGD1P98174 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGD1P98174 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGD1P98174 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGD1P98174 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGD1P98174 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGD1P98174 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGD1P98174 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGD1P98174 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGD1P98174 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGD1P98174 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGD1P98174 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FGD1P98174 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGD1P98174 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGD1P98174 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGD1P98174 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGD1P98174 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGD1P98174 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FGD1P98174 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGD1P98174 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGD1P98174 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGD1P98174 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGD1P98174 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGD1P98174 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGD1P98174 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGD1P98174 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGD1P98174 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGD1P98174 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGD1P98174 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGD1P98174 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGD1P98174 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGD1P98174 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGD1P98174 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGD1P98174 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGD1P98174 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGD1P98174 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGD1P98174 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGD1P98174 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGD1P98174 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGD1P98174 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGD1P98174 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGD1P98174 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGD1P98174 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGD1P98174 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGD1P98174 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGD1P98174 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD1P98174 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD1P98174 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD1P98174 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD1P98174 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD1P98174 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD1P98174 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD1P98174 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD1P98174 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD1P98174 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD1P98174 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD1P98174 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD1P98174 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD1P98174 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD1P98174 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD1P98174 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD1P98174 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD1P98174 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD1P98174 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD1P98174 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGD1P98174 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD1P98174 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD1P98174 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD1P98174 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD1P98174 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms