Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SKOR1P84550 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SKOR1P84550 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
SKOR1P84550 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SKOR1P84550 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SKOR1P84550 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR1P84550 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR1P84550 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR1P84550 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR1P84550 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR1P84550 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR1P84550 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR1P84550 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR1P84550 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SKOR1P84550 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR1P84550 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR1P84550 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR1P84550 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR1P84550 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR1P84550 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR1P84550 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR1P84550 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR1P84550 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SKOR1P84550 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SKOR1P84550 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms