Protein–RNA interactions for Protein: P78386

KRT85, Keratin, type II cuticular Hb5, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT85P78386 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT85P78386 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT85P78386 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT85P78386 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT85P78386 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT85P78386 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT85P78386 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT85P78386 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT85P78386 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT85P78386 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT85P78386 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT85P78386 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT85P78386 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT85P78386 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT85P78386 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT85P78386 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT85P78386 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT85P78386 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT85P78386 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT85P78386 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT85P78386 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT85P78386 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT85P78386 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT85P78386 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT85P78386 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT85P78386 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT85P78386 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT85P78386 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT85P78386 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT85P78386 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT85P78386 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT85P78386 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT85P78386 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT85P78386 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT85P78386 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT85P78386 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT85P78386 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT85P78386 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT85P78386 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT85P78386 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT85P78386 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT85P78386 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT85P78386 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT85P78386 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT85P78386 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT85P78386 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT85P78386 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT85P78386 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT85P78386 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT85P78386 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT85P78386 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT85P78386 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT85P78386 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT85P78386 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT85P78386 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT85P78386 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT85P78386 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT85P78386 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT85P78386 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT85P78386 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT85P78386 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT85P78386 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT85P78386 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT85P78386 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT85P78386 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT85P78386 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT85P78386 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT85P78386 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT85P78386 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT85P78386 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT85P78386 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT85P78386 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT85P78386 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT85P78386 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT85P78386 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT85P78386 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT85P78386 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT85P78386 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT85P78386 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT85P78386 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT85P78386 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT85P78386 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT85P78386 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT85P78386 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT85P78386 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT85P78386 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT85P78386 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT85P78386 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT85P78386 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT85P78386 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT85P78386 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT85P78386 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT85P78386 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT85P78386 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT85P78386 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT85P78386 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT85P78386 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT85P78386 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT85P78386 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT85P78386 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms