Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SH3BP2P78314 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2P78314 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2P78314 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2P78314 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2P78314 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2P78314 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2P78314 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2P78314 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2P78314 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2P78314 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2P78314 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2P78314 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2P78314 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2P78314 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2P78314 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2P78314 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2P78314 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP2P78314 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP2P78314 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP2P78314 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP2P78314 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP2P78314 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP2P78314 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP2P78314 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP2P78314 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP2P78314 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BP2P78314 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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