Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ACTA1P68133 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms