Protein–RNA interactions for Protein: P68036

UBE2L3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2L3P68036 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2L3P68036 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2L3P68036 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2L3P68036 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2L3P68036 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2L3P68036 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2L3P68036 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2L3P68036 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2L3P68036 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2L3P68036 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2L3P68036 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2L3P68036 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2L3P68036 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2L3P68036 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2L3P68036 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2L3P68036 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2L3P68036 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2L3P68036 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2L3P68036 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2L3P68036 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2L3P68036 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2L3P68036 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2L3P68036 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2L3P68036 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2L3P68036 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2L3P68036 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2L3P68036 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2L3P68036 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms