Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOBP62745 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOBP62745 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOBP62745 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOBP62745 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOBP62745 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOBP62745 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOBP62745 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOBP62745 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOBP62745 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOBP62745 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOBP62745 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOBP62745 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOBP62745 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOBP62745 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOBP62745 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOBP62745 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOBP62745 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOBP62745 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOBP62745 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOBP62745 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOBP62745 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOBP62745 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOBP62745 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOBP62745 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOBP62745 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOBP62745 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOBP62745 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOBP62745 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOBP62745 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOBP62745 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOBP62745 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOBP62745 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOBP62745 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOBP62745 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOBP62745 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOBP62745 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOBP62745 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOBP62745 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOBP62745 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOBP62745 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOBP62745 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOBP62745 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOBP62745 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOBP62745 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOBP62745 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOBP62745 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOBP62745 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOBP62745 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOBP62745 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOBP62745 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOBP62745 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOBP62745 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOBP62745 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOBP62745 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOBP62745 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOBP62745 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOBP62745 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOBP62745 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOBP62745 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOBP62745 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOBP62745 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOBP62745 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOBP62745 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOBP62745 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOBP62745 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOBP62745 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOBP62745 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOBP62745 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOBP62745 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOBP62745 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOBP62745 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOBP62745 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOBP62745 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOBP62745 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOBP62745 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOBP62745 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOBP62745 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOBP62745 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOBP62745 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOBP62745 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOBP62745 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOBP62745 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOBP62745 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOBP62745 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOBP62745 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOBP62745 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOBP62745 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOBP62745 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOBP62745 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOBP62745 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOBP62745 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOBP62745 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOBP62745 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOBP62745 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOBP62745 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOBP62745 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOBP62745 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOBP62745 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOBP62745 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms