Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DCDC1P59894 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms