Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP1P56182 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP1P56182 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP1P56182 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP1P56182 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP1P56182 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP1P56182 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP1P56182 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP1P56182 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP1P56182 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP1P56182 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP1P56182 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP1P56182 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRP1P56182 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP1P56182 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP1P56182 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP1P56182 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP1P56182 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP1P56182 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP1P56182 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP1P56182 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP1P56182 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP1P56182 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP1P56182 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP1P56182 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP1P56182 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP1P56182 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP1P56182 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP1P56182 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP1P56182 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP1P56182 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRP1P56182 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP1P56182 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP1P56182 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP1P56182 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP1P56182 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP1P56182 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP1P56182 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP1P56182 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP1P56182 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP1P56182 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP1P56182 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP1P56182 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP1P56182 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRP1P56182 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP1P56182 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP1P56182 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP1P56182 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP1P56182 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP1P56182 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP1P56182 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP1P56182 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP1P56182 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP1P56182 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP1P56182 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP1P56182 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP1P56182 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP1P56182 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP1P56182 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP1P56182 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP1P56182 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP1P56182 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP1P56182 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP1P56182 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP1P56182 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRP1P56182 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP1P56182 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP1P56182 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP1P56182 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP1P56182 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP1P56182 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP1P56182 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRP1P56182 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP1P56182 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP1P56182 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP1P56182 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP1P56182 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP1P56182 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP1P56182 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP1P56182 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP1P56182 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RRP1P56182 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP1P56182 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP1P56182 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP1P56182 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP1P56182 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP1P56182 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP1P56182 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP1P56182 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP1P56182 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP1P56182 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP1P56182 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP1P56182 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP1P56182 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP1P56182 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP1P56182 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRP1P56182 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP1P56182 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP1P56182 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP1P56182 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms